Este espaço foi inaugurado em 2009 e com as obras de arte presentes quer o Santuário levar os peregrinos a meditarem no mistério insondável da misericórdia de Deus.

No lado direito está o quadro alusivo às revelações que Jesus fez a Santa Faustina Kowascka em 1932 na Polónia, onde lhe pede que seja instituída a festa da sua Misericórdia no domingo a seguir à Oitava da Pascoa. O pedido é atendido no ano 2000 pelo Papa S. João Paulo II.

No lado esquerdo, na parede de baixo estão 2 quadros. Um referente ao regresso do filho Pródigo onde o Pai se alegra com o seu regresso colocando-lhe o anel no dedo e oferecendo-lhe um par de sandálias para colocar nos pés. Esta pintura faz referência à passagem bíblica escrita no Evangelho de Lucas (Lc 15, 11- 32).

O segundo quadro faz referência à mulher pecadora que lava os pés de Jesus com perfume, chorando sobre eles e enxugando-os com os seus cabelos. Este quadro faz referência também ao Evangelho de Lucas (Lc 7, 36- 39)

Na parede superior a estes quadros encontra-se a instituição do Sacramento da Reconciliação por Jesus na tarde de Domingo de Pascoa, faz-se, assim, alusão à passagem bíblica de Jo 20, 19- 23.

Na parede em frente da porta está uma grande obra alusiva a nossa Senhora da Misericórdia, estando ao centro, ladeada com 14 quadros pequenos quadros alusivos às 14 obras de misericórdia, a saber: Dar de comer a quem tem fome; Dar de beber a quem tem sede; Vestir os nus; Dar pousada aos peregrinos; Visitar os enfermos; Visitar os presos; Enterrar os mortos; Dar bons conselhos; Ensinar os ignorantes; Corrigir os que erram; Consolar os tristes; Perdoar as injúrias; Sofrer com paciência as fraquezas do nosso próximo; Rezar a Deus por vivos e defuntos.

Abaixo do políptico de Nossa Senhora da Misericórdia encontra-se um Altar encimado por um Sacrário, para a Reserva Eucarística na Quinta -feira Santa.
À esquerda temos uma imagem de Nossa Senhora e à direita uma imagem de São José. O espaço está delimitado por uma balaustrada.

O Santuário dispõe dum pequeno desdobrável onde explica todos os quadros.